2001年8月-9月，福建CA中心办公区和核心机房竣工，福建CA中心开始试运行。

2001年10月15日，福建省副省长黄小晶一行视察了CA中心，宣告福建CA中心成立。

2001年11月，国密办副主任王勇格、商密办主任王长喜到福建CA中心检查工作。

2002年1月，福建CA中心获得了省物价局关于确定数字证书服务价格的批文。

2002年1月16日，福建省省长习近平、副省长黄小晶、贾锡太、潘心城等一行视察了福建CA中心，点击CA证书系统启动按钮，标志着福建CA中心的正式开通，并为省长们发出了第一批数字证书。

2002年1月26日，福建CA中心通过国家密码办组织的技术鉴定，成为我国首家通过国家密码办技术鉴定的区域性CA中心。

2002年2月，正式在福建省经济组织认证系统中，颁发企业数字证书。

2002年4月，由福建CA中心和省经贸委合作的“福建省经贸委网上办公系统”正式开通运行。

2002年7月，福建省常委、福州市市委书记何立峰到福建CA中心视察。

2002年10月，福建CA中心的数字证书正式在福建省药品集中招标、集中议价采购电子商务系统中应用。

2003年10月13日，根据《国家发展改革委关于CA互联互通示范工程项目可行性研究报告的批复》（发改高技[2003]1201号），同意将福建CA列入国家高技术产业发展项目中的信息安全专项。

2004年11月20日，福建省社会劳动保险网上申报系统于2004年11月20日正式开通。

2004年12月14日，在第三届“泛珠三角洲区域合作”信息产业厅（局）长联席会议上，福建CA中心与参会的CA中心签订了《CA互联互通合作意向书》。

2004年12月30日，全省社保业务网上申报将于2005年全面推广。

2005年1月6日，“CA互联互通示范工程入桥CA系统改造项目”通过国家信息中心信息安全研究与服务中心的验收。

2005年12月5日，国家信息产业部电子认证服务管理办公室对福建CA中心的运营环境进行现场实质性审查。

2006年1月23日，福建CA中心获得了国家信息产业部颁发的电子认证服务许可证。

2006年3月15日，福建省企业工商网上年检正式开展。在福建省所有工商局登记的，已领取福建省数字安全证书的企业，可以在福建省工商局的“企业网上年检服务系统”中进行年检申报。